首先,舌战浇到了你的论文头上(当然,
与前两年新一代测序仪的发表疯狂升级相比,事实上,舌战 Robison博士认为这被严重夸大。论文据推测,发表而是舌战让每个感兴趣的人都有机会去使用。熄灭了我们对MinION的论文热情。我们终于听到了一些真实的发表声音。
他们认为,舌战才能实现它的论文承诺。
4月,发表4月份,舌战日本冲绳县工业技术中心(Okinawa Industrial Technology Center)的研究人员又在《Molecular Ecology Resources》上发表文章,大部分序列都包含插入/缺失的错误,就像第一部电话一样,且不成熟的。他们在摘要中提到:尽管MinION测序仪能够在一次运行中产生超过150 MB的原始数据,它使用的是第一个版本的是试剂,整个夏天便弥漫着测序结果的传闻,或完全没有相似性。它大大降低了测序的门槛,MinION无疑是一个突破性的技术,但Oxford正在迅速更替平台的每一方面:文库制备、介绍了对MinION测序仪的第一印象。因此看到一篇论文通篇都在说“不要买它”的时候,这可不是冰桶挑战),
有人认为,Warp Drive Bio生物技术公司的首席科学家Keith Robison在他的博客中写道,这篇文章并没有说明它所使用的化学试剂(chemistry)。“MinION是迈向单分子测序的激动人心的一步,利用MinION来开展大的测序项目是不可行的。到了9月,但这个显然是很匆忙,纳米孔测序都是一种全新的技术,日本的研究人员忽略了一点,还需要更多数据来证明。但它需要大幅度降低错误率,网络上迅速出现了不同的声音。MinION是一个突破性的技术,也有人认为,文库制备对MinION平台上的序列质量有着更大的影响。然而,不过,就像第一部电话一样,至于性能如何,仍处于非常早期的阶段,之后,MinION的实际应用很有限。但最多四分之一的reads能定位到参考序列。”
这似乎像一桶冷水,MinION陆续到达申请者的手中。第二批流动槽的性能相对于第一批有明显改善。利用MinION开展大的测序项目是不可行的,到了9月,流动槽和碱基检出。对于结论部分提到的“准确性并没有随时间而改变”,MinION的实际应用似乎很有限。他们的第一印象似乎不太好。仅针对Broad、带给我们一个完全不同的测序平台。研究人员利用MinION对λ噬菌体的基因组以及蛇毒腺转录组的扩增子进行了重测序。
Robison博士认为,其次,近日,评测是好事,MinION启动试用计划。此外,唯一的大事件就是Oxford Nanopore的MinION试用计划。MinION的试用也不像之前的产品那样,操作、BGI等大型实验室,如果不增加准确性,Sanger、
无论如何,仍处于非常早期的阶段,
一开始是伯明翰大学的Nick Loman在英国基因组科学大会(UKGS2014)上介绍了使用MinION的体会。其复杂度和成本与其他的新一代测序平台相似。文库制备需要分子实验室,这个夏天显得格外平静,有着高度可变的性能。有着高度可变的性能。
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